Rooftop cihazlarının bakımı biraz zaman almaktadır, sebebi ise içinde hem havalandırma hem de soğutma ünitelerini içerdikleri içindir.

Başta kompresör-evaporatör bölümleri olmak üzere filtre, kayış, vana, fan-motor bölümleri de iyi bir bakım gerektirmektedir.

Rooftop klima bakımını sürekli yaptırmak gerekmektedir, bu şekilde büyük bir önem taşıyan sistemin sorunsuz şekilde çalışması sağlanmaktadır.